新生儿出现幽门肥厚，可自愈的可能性比较小，需要根据婴儿的具体症状判断治疗的方法，如果消化道的症状比较轻，没有明显的呕吐或者营养不良的现象，可以观察一段时间，如果由于幽门肥厚出现了梗阻，引起的消化不良，营养差等现象，需要及时的手术治疗，解决局部梗阻的现象。